理事会

根据《中央财经大学政信研究院章程》的规定，研究院目前已初步建立起决策权、执行权、监督权既相互制约又相互协调的治理结构。研究院设两个最高治理机构，分别为理事会与学术委员会。其中，理事会是研究院的最高决策机构。理事会负责制定研究院的章程，审议批准研究院的中长期发展规划和年度工作计划及预算安排，聘任院长，审议研究院的重大管理制度等。

学术委员会

根据《中央财经大学政信研究院章程》章程，学术委员会为研究院最高学术机构，负责长期发展战略思路、战略步骤的咨询和制定；研究院发展培育过程的监督和评估；审议研究院科学研究、决策咨询规划和年度科研计划；审议研究院人才培养计划；以及其他须由学术委员会审议的事项等。

院务会

研究院实行理事会领导下的院长负责制，内部机构设置包括项目投融资研究中心、PPP研究中心、社会保障研究中心、政信咨询服务中心、中央财经大学财税大数据实验室等。